Tijdens de Tweede Wereldoorlog werkte hij als adviseur
aan verschillende militaire projecten mee. Kort na het
begin van de oorlog werd hij lid van het Manhattan
Engineer District en later werkte hij in het Los
Alamos Scientific Laboratory aan projecten in verband met
de beheersing van kernreacties.
Dankzij een toevallige ontmoeting met Herman Goldstine
werd von Neumann op hoogte gesteld van het ENIAC-project.
De ENIAC
werd reeds voor zijn officiële voorstelling gebruikt om
berekeningen voor Los Alamos te maken.